TY - JOUR AU - Jacob, F. AU - Monod, J. PY - 1961 DA - 1961// TI - Genetic regulatory mechanisms in the synthesis of proteins JO - J Mol Biol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(61)80072-7 DO - 10.1016/S0022-2836(61)80072-7 ID - Jacob1961 ER - TY - JOUR AU - Pabo, C. O. AU - Sauer, R. T. PY - 1992 DA - 1992// TI - Transcription factors: structural families and principles of DNA recognition JO - Annu Rev Biochem VL - 61 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.bi.61.070192.005201 DO - 10.1146/annurev.bi.61.070192.005201 ID - Pabo1992 ER - TY - JOUR AU - Gama-Castro, S. AU - Jimenez-Jacinto, V. AU - Peralta-Gil, M. AU - Santos-Zavaleta, A. AU - Penaloza-Spinola, M. I. AU - Contreras-Moreira, B. AU - Segura-Salazar, J. AU - Muniz-Rascado, L. AU - Martinez-Flores, I. AU - Salgado, H. AU - Bonavides-Martinez, C. AU - Abreu-Goodger, C. AU - Rodriguez-Penagos, C. AU - Miranda-Rios, J. AU - Morett, E. AU - Merino, E. AU - Huerta, A. M. AU - Trevino-Quintanilla, L. AU - Collado-Vides, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - RegulonDB (version 6.0): gene regulation model of Escherichia coliK-12 beyond transcription, active (experimental) annotated promoters and Textpresso navigation JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm994 DO - 10.1093/nar/gkm994 ID - Gama-Castro2008 ER - TY - JOUR AU - Sierro, N. AU - Makita, Y. AU - de Hoon, M. AU - Nakai, K. PY - 2008 DA - 2008// TI - DBTBS: a database of transcriptional regulation in Bacillus subtiliscontaining upstream intergenic conservation information JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm910 DO - 10.1093/nar/gkm910 ID - Sierro2008 ER - TY - JOUR AU - Barabasi, A. L. AU - Oltvai, Z. N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Network biology: understanding the cell's functional organization JO - Nat Rev Genet VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nrg1272 DO - 10.1038/nrg1272 ID - Barabasi2004 ER - TY - JOUR AU - Shen-Orr, S. S. AU - Milo, R. AU - Mangan, S. AU - Alon, U. PY - 2002 DA - 2002// TI - Network motifs in the transcriptional regulation network of Escherichia coli JO - Nat Genet VL - 31 UR - https://doi.org/10.1038/ng881 DO - 10.1038/ng881 ID - Shen-Orr2002 ER - TY - JOUR AU - Baumbach, J. AU - Rahmann, S. AU - Tauch, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Reliable transfer of transcriptional gene regulatory networks between taxonomically related organisms JO - BMC Syst Biol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/1752-0509-3-8 DO - 10.1186/1752-0509-3-8 ID - Baumbach2009 ER - TY - JOUR AU - Balazsi, G. AU - Heath, A. P. AU - Shi, L. AU - Gennaro, M. L. PY - 2008 DA - 2008// TI - The temporal response of the Mycobacterium tuberculosisgene regulatory network during growth arrest JO - Mol Syst Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/msb.2008.63 DO - 10.1038/msb.2008.63 ID - Balazsi2008 ER - TY - CHAP AU - Guo, M. AU - Feng, H. AU - Zhang, J. AU - Wang, W. AU - Wang, Y. AU - Li, Y. AU - Gao, C. AU - Chen, H. AU - Feng, Y. AU - He, Z. G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Dissecting transcription regulatory pathways through a new bacterial one-hybrid reporter system BT - Genome Res ID - Guo2009 ER - TY - JOUR AU - Madan Babu, M. AU - Teichmann, S. A. AU - Aravind, L. PY - 2006 DA - 2006// TI - Evolutionary dynamics of prokaryotic transcriptional regulatory networks JO - J Mol Biol VL - 358 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2006.02.019 DO - 10.1016/j.jmb.2006.02.019 ID - Madan Babu2006 ER - TY - JOUR AU - Mazon, G. AU - Lucena, J. M. AU - Campoy, S. AU - Fernandez de Henestrosa, A. R. AU - Candau, P. AU - Barbe, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - LexA-binding sequences in Gram-positive and cyanobacteria are closely related JO - Mol Genet Genomics VL - 271 UR - https://doi.org/10.1007/s00438-003-0952-x DO - 10.1007/s00438-003-0952-x ID - Mazon2004 ER - TY - JOUR AU - Rodriguez-Penagos, C. AU - Salgado, H. AU - Martinez-Flores, I. AU - Collado-Vides, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Automatic reconstruction of a bacterial regulatory network using natural language processing JO - BMC Bioinformatics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-293 DO - 10.1186/1471-2105-8-293 ID - Rodriguez-Penagos2007 ER -